Отделение гнойной хирургии предназначено для оказания квалифицированной, высокотехнологичной помощи пациентам с гнойными заболеваниями, гнойными осложнениями перенесенных хирургических вмешательств, осложненной  травмой, химическими и термическими ожогами, холодовой травмой, последствиями химических ожогов желудочно-кишечного тракта, проктологическими заболеваниями, синдромом диабетической стопы.  
 В отделении имеются 14 палат, в том числе 2-х и одноместные палаты, два процедурных кабинета, две перевязочные для гнойных больных и отдельная перевязочная (смотровой кабинет) для больных проктологического профиля.  
 К лечению больных в отделении (в т.ч. оперативном) привлекаются, по мере необходимости, профильные специалисты: терапевт, кардиолог, эндокринолог, ангиохирург, нейрохирург, травматолог-комбустиолог.      
 В отделении широко используются современные методы диагностики и лечения: магнитно-резонансная и компьютерная томография, рентгенэндоваскулярные вмешательства у больных с атеросклерозом и синдромом диабетической стопы, вмешательства под контролем УЗИ, видеолапароскопические манипуляции и операции. Внедрены и активно применяются при ведении гнойных ран методы гидрохирургической обработки (аппарат  Versajet), лечение гнойных ран отрицательным давлением (Vivano, Renasys).     

Плановая госпитализация:
– Хронический остеомиелит.
– Гнойные свищи кожи, подкожной клетчатки, брюшной и грудной полости.
– Сформированные и несформированные свищи: желудочные, тонко- и толстокишечные, желчные, панкреатические, параректальные.
– Эхинококкоз.
– Очаговые гнойные заболевания (абсцессы, кисты) паренхиматозных органов (печень, поджелудочная железа, селезенка).
– Рубцовая стриктура пищевода.
– Хронический парапроктит, свищевая форма.
– Полипоз толстой кишки.
– Анальная трещина.
– Хронический геморрой.
– Ректоцеле.
– Эпителиальный копчиковый ход.
– Ректо-вагинальный свищ.

Экстренная госпитализация:
– Острые заболевания органов брюшной полости с гнойными осложнениями (о. аппендицит, о. холецистит, о. панкреатит, прободная язва желудка и 12пк, ущемленные грыжи, острая кишечная непроходимость).
– Тромбоз мезентериальных сосудов с некрозом кишки и перитонитом.
– Болезнь Крона, дивертикулярная болезнь толстой кишки, неспецифический язвенный колит, осложненные перфорацией, кровотечением.
– Флегмона желудка.
– Перфоративный колоректальный рак.
– Инородные тела желудочно-кишечного тракта с гнойными осложнениями.
– Непроходимость пищевода (стриктура, сдавление опухолью), требующая наложения гастро-, энтеростомы.
– Абсцессы брюшной полости и забрюшинного пространства.
– Флегмоны забрюшинного пространства и таза.
– Острый тромбоз геморроидальных узлов.
– Нагноившаяся киста копчика.
– Острый парапроктит.
– Абсцессы и флегмоны мягких тканей.
– Буллезно-некротическая форма рожистого воспаления.
– Гнойные заболевания кожи и подкожной клетчатки (фурункул, карбункул, гидраденит, триходермальная киста).
– Гнойные заболевания кисти.
– Клостридиальная и неклостридиальная инфекция.
– Ишемическая гангрена конечностей.
– Воспалительные заболевания молочных желез.
– Онкологические заболевания молочных желез с гнойными осложнениями.
– Синдром диабетической стопы.
– Термические, химические и электроожоги всех локализаций.
– Отморожения.
– Переломы костей, осложненные гнойной инфекцией.
– Гнойный спондилодисцит.

Осложнения хирургических и терапевтических вмешательств:
– Гнойные заболевания костей, суставов после эндопротезирования и металлоостеосинтеза.
– Нагноившиеся гематомы (посттравматические и послеоперационные).
– Расхождение крев послеоперационной раны, эвентрация.
– Нагноение послеоперационной раны.
– Лигатурные свищи.
– Случайная перфорация или разрыв органов (эндоскопом, инструментами во время выполнения обследования, операций, манипуляций).
– Последствия других и неуточненных внешних причин.

Отделение располагается на третьем этаже 1-го хирургического корпуса.

Отделение открыто в 2004 году. В 2004-2014 г отделением заведовал Сергей Тихонович Кулаков. В 2014 году заведующим отделением назначен Юрий Николаевич Бавыкин.